申請/專利權人:南京工業大學
申請日:2022-11-21
公開(公告)日:2023-03-17
公開(公告)號:CN115810399A
主分類號:G16B40/00
分類號:G16B40/00;G16B20/00;G06F18/24;G06F18/214
優先權:["20221114 CN 202211417704X"]
專利狀態碼:在審-公開
法律狀態:2023.03.17#公開
摘要:一種肺腺癌組織學亞型的分析方法,是由轉錄模式揭示,步驟包括:肺腺癌不同組織學模式的樣本間進行差異分析,得到模式間顯著差異基因;差異基因與免疫基因集取交集,得到免疫相關差異基因;對免疫相關差異基因進行GO和KEGG通路富集分析,得到基因顯著富集的生物通路,進一步篩選得到38個組織學模式免疫特征基因。一種揭示腫瘤組織學亞型的方法,由38個組織學模式免疫特征基因的轉錄組揭示L組織學亞型、PA組織學亞型和S組織學亞型。一種基于轉錄模式的肺腺癌腫瘤組織學亞型的分類模型,是由多層感知器構建;38個組織學模式免疫特征基因轉錄組表達量作為分類模型的輸入,經過隱藏層,輸出L、PA和S三種組織學模式分類。
主權項:1.一種肺腺癌組織學亞型的分析方法,其特征在于,是由免疫特征基因轉錄組揭示,步驟包括:步驟1在肺腺癌不同組織學模式的樣本間進行差異分析,得到模式間顯著差異基因;步驟2把差異基因與免疫基因集取交集,得到免疫相關差異基因;步驟3對免疫相關差異基因進行GO和KEGG通路富集分析,得到基因顯著富集的生物通路,得到38個組織學模式特征基因,即所需免疫相關差異基因。
全文數據:
權利要求:
百度查詢: 南京工業大學 一種基于轉錄模式的肺腺癌組織學亞型分類方法
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